Основным документом, которым определена структура Хабаровского краевого общественного движения "Мемориал" и порядок управления им, является Устав движения.

Согласно Устава, ХКД «Мемориал» состоит из региональных отделений и вступивших в него организаций – юридических лиц - общественных объединений. Территориальное строение ХКД «Мемориал» соответствует административно-территориальному делению Хабаровскому края. В состав ХКД «Мемориал» могут входить районные, городские, поселковые и сельские отделения. Если на территории административно-территориального образования отделение ХКД «Мемориал» не создавалось, то уставную деятельность ХКД «Мемориал» на территории этого образования осуществляют уполномоченные-координаторы.

В настоящее время уполномоченные-координаторы ХКД "Мемориал" действуют в двенадцати населённых пунктах Хабаровского края:

Город Бикин, Бикинского муниципального района

Город Вяземский, Вяземского муниципального района

Городские округа, города Хабаровск

Поселок Дурмин, Муниципального района им. Лазо

Поселок Сидима, Муниципального района им. Лазо

Рабочий поселок Ванино, Ванинского муниципального района

Рабочий поселок Переяславка, Муниципального района им. Лазо

Рабочий поселок Чегдомын, Верхнебуреинского муниципального района

Село Бичевая, Муниципального района им. Лазо

Село Богородское, Ульчского муниципального района

Село Кукан, Хабаровского муниципального района

Село Джонки, Нанайского муниципального района

Село Троицкое, Нанайского муниципального района

Руководящими органами ХКД «Мемориал» являются:

• Высшим руководящим органом ХКД «Мемориал» является Отчетно-выборная конференция, созываемая один раз в три года. В Отчетно-выборной конференции принимают участие делегаты от отделений ХКД «Мемориал». Очередная конференция прошла 20 апреля 2018 года.
  
  
• Постоянно действующим руководящим органом ХКД "Мемориал" является Правление, избираемое на три года на Отчетно-выборной конференции. Общее число членов Правления не может превышать 15 человек. В состав Правления входят: Председатель Правления, два заместителя, Секретарь, Казначей и члены Правления. Все руководящие лица Правления избираются из числа членов Правления на первом организационном совещании Правления ХКД «Мемориал».
  

В настоящее время в Правление входит 15 членов Правления.